DBD: Transcription factor prediction database

Release 2.0
www.transcriptionfactor.org
Sequence ID search:
Entamoeba histolytica 1
Taxonomy: Eukaryota; Entamoebidae; Entamoeba
source (downloaded: 2005-09-08)

Each predicted transcription factor is displayed with its SUPERFAMILY (SF) as well as PFAM (PF) architecture.
The domain architectures are represented as colored rectangles and oblongs on a black line corresponding to the polypeptide chain.
The oblongs represent DNA-binding domains, and the rectangles represent domains with other functions.
The numbers inside the SF rectangles represent the SF database identifier for that protein superfamily, and are linked to a detailed description.
The PFAM identifiers inside the boxes are also linked to detailed descriptions of the family.
The long family name can be viewed by holding the mouse over a colored rectangle.
All the domains belonging to one family have the same colored rectangle.
Colors are reused for different families, so that two different families can be represented by the same color.

The sequence ID links provide more detailed results for each predicted transcription factor.
External links are also provided, when available.
Common gene names are provided for the model organisms: Bacillus subtilis, Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Homo sapiens, Mus musculus, Saccharomyces cerevisiae. and Salmonella typhimurium LT2.

The full repertoire of transcription factors may be distributed across several pages of results.
These can be accessed by clicking on the individual page numbers, or downloading the entire set of results from the Download section.


 
Details Genome DB Domain architecture
527.m00015 External link en SF
  en PF
77.m00162 External link en SF
  en PF
91.m00194 External link en SF
  en PF
177.m00097 External link en SF
  en PF
6.m00479 External link en SF
  en PF
49.m00176 External link en SF
  en PF
364.m00045 External link en SF
  en PF
212.m00083 External link en SF
  en PF
447.m00050 External link en SF
  en PF
155.m00091 External link en SF
  en PF
217.m00082 External link en SF
  en PF
203.m00116 External link en SF
  en PF
105.m00123 External link en SF
  en PF
39.m00239 External link en SF
  en PF
415.m00042 External link en SF
  en PF
6.m00448 External link en SF
  en PF
366.m00043 External link en SF
  en PF
151.m00091 External link en SF
  en PF
15.m00340 External link en SF
  en PF
84.m00129 External link en SF
  en PF
22.m00264 External link en SF
  en PF
200.m00089 External link en SF
  en PF
113.m00160 External link en SF
  en PF
197.m00084 External link en SF
  en PF No hits
328.m00059 External link en SF
  en PF No hits
30.m00236 External link en SF
  en PF
132.m00097 External link en SF
  en PF No hits
219.m00083 External link en SF
  en PF
24.m00281 External link en SF
  en PF No hits
21.m00258 External link en SF
  en PF
30.m00233 External link en SF
  en PF
487.m00051 External link en SF
  en PF No hits
169.m00116 External link en SF
  en PF
114.m00151 External link en SF
  en PF
55.m00197 External link en SF
  en PF
337.m00054 External link en SF
  en PF
523.m00034 External link en SF
  en PF
31.m00199 External link en SF
  en PF
4.m00581 External link en SF
  en PF
541.m00038 External link en SF
  en PF
9.m00365 External link en SF
  en PF
191.m00110 External link en SF
  en PF
3.m00587 External link en SF
  en PF
185.m00106 External link en SF
  en PF
511.m00032 External link en SF
  en PF
146.m00110 External link en SF
  en PF
91.m00173 External link en SF
  en PF
783.m00006 External link en SF
  en PF
343.m00073 External link en SF
  en PF
55.m00187 External link en SF
  en PF