DBD: Transcription factor prediction database

Release 2.0
www.transcriptionfactor.org
Sequence ID search:
Felis catus 49_1c (longest transcript per gene)
Taxonomy: Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Laurasiatheria; Carnivora; Feliformia; Felidae; Felinae; Felis
source (downloaded: 2008-03-21)

The longest transcript per gene genomes use the longest transcript as the single representative protein for each gene.

Each predicted transcription factor is displayed with its SUPERFAMILY (SF) as well as PFAM (PF) architecture.
The domain architectures are represented as colored rectangles and oblongs on a black line corresponding to the polypeptide chain.
The oblongs represent DNA-binding domains, and the rectangles represent domains with other functions.
The numbers inside the SF rectangles represent the SF database identifier for that protein superfamily, and are linked to a detailed description.
The PFAM identifiers inside the boxes are also linked to detailed descriptions of the family.
The long family name can be viewed by holding the mouse over a colored rectangle.
All the domains belonging to one family have the same colored rectangle.
Colors are reused for different families, so that two different families can be represented by the same color.

The sequence ID links provide more detailed results for each predicted transcription factor.
External links are also provided, when available.
Common gene names are provided for the model organisms: Bacillus subtilis, Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Homo sapiens, Mus musculus, Saccharomyces cerevisiae. and Salmonella typhimurium LT2.

The full repertoire of transcription factors may be distributed across several pages of results.
These can be accessed by clicking on the individual page numbers, or downloading the entire set of results from the Download section.


 
Details Genome DB Domain architecture
ENSFCAP00000008802 External link f1 SF
  f1 PF No hits
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  f1 PF
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  f1 PF
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  f1 PF
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  f1 PF
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  f1 PF
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ENSFCAP00000009995 External link f1 SF
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  f1 PF
ENSFCAP00000012651 External link f1 SF
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ENSFCAP00000002327 External link f1 SF
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ENSFCAP00000005109 External link f1 SF
  f1 PF
ENSFCAP00000003265 External link f1 SF
  f1 PF