DBD: Transcription factor prediction database

Release 2.0
www.transcriptionfactor.org
Sequence ID search:
Coccidioides immitis RS
Taxonomy: Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Eurotiomycetes; Eurotiomycetidae; Onygenales; mitosporic Onygenales; Coccidioides
source (downloaded: 2007-07-14)

Each predicted transcription factor is displayed with its SUPERFAMILY (SF) as well as PFAM (PF) architecture.
The domain architectures are represented as colored rectangles and oblongs on a black line corresponding to the polypeptide chain.
The oblongs represent DNA-binding domains, and the rectangles represent domains with other functions.
The numbers inside the SF rectangles represent the SF database identifier for that protein superfamily, and are linked to a detailed description.
The PFAM identifiers inside the boxes are also linked to detailed descriptions of the family.
The long family name can be viewed by holding the mouse over a colored rectangle.
All the domains belonging to one family have the same colored rectangle.
Colors are reused for different families, so that two different families can be represented by the same color.

The sequence ID links provide more detailed results for each predicted transcription factor.
External links are also provided, when available.
Common gene names are provided for the model organisms: Bacillus subtilis, Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Homo sapiens, Mus musculus, Saccharomyces cerevisiae. and Salmonella typhimurium LT2.

The full repertoire of transcription factors may be distributed across several pages of results.
These can be accessed by clicking on the individual page numbers, or downloading the entire set of results from the Download section.


 
Details Genome DB Domain architecture
CIMG_06036 im SF
  im PF
CIMG_05930 im SF
  im PF
CIMG_07253 im SF
  im PF
CIMG_00643 im SF
  im PF
CIMG_10005 im SF
  im PF
CIMG_00087 im SF
  im PF
CIMG_09294 im SF
  im PF No hits
CIMG_05044 im SF
  im PF
CIMG_07219 im SF
  im PF
CIMG_01608 im SF
  im PF
CIMG_04548 im SF
  im PF
CIMG_04661 im SF
  im PF
CIMG_10021 im SF
  im PF
CIMG_01271 im SF
  im PF
CIMG_07829 im SF
  im PF
CIMG_07643 im SF
  im PF
CIMG_04610 im SF
  im PF
CIMG_04206 im SF
  im PF
CIMG_09087 im SF
  im PF
CIMG_02802 im SF
  im PF
CIMG_00672 im SF
  im PF
CIMG_04417 im SF
  im PF
CIMG_06762 im SF
  im PF
CIMG_04625 im SF
  im PF
CIMG_08688 im SF
  im PF
CIMG_08562 im SF
  im PF
CIMG_08114 im SF
  im PF
CIMG_04520 im SF
  im PF
CIMG_01298 im SF
  im PF
CIMG_05220 im SF
  im PF
CIMG_03032 im SF
  im PF
CIMG_01498 im SF
  im PF No hits
CIMG_10246 im SF
  im PF
CIMG_10322 im SF
  im PF No hits
CIMG_02061 im SF
  im PF
CIMG_01913 im SF
  im PF
CIMG_03190 im SF
  im PF
CIMG_03889 im SF
  im PF
CIMG_01957 im SF
  im PF
CIMG_03042 im SF
  im PF
CIMG_00707 im SF
  im PF
CIMG_01325 im SF
  im PF
CIMG_08556 im SF
  im PF
CIMG_04457 im SF
  im PF
CIMG_08108 im SF
  im PF
CIMG_01795 im SF
  im PF
CIMG_03723 im SF
  im PF
CIMG_03335 im SF
  im PF
CIMG_07027 im SF
  im PF
CIMG_00917 im SF
  im PF