DBD: Transcription factor prediction database

Release 2.0
www.transcriptionfactor.org
Sequence ID search:
Schizosaccharomyces pombe 972h-
Taxonomy: Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Taphrinomycotina; Schizosaccharomycetes; Schizosaccharomycetales; Schizosaccharomycetaceae; Schizosaccharomyces
source (downloaded: 2008-08-27)

Each predicted transcription factor is displayed with its SUPERFAMILY (SF) as well as PFAM (PF) architecture.
The domain architectures are represented as colored rectangles and oblongs on a black line corresponding to the polypeptide chain.
The oblongs represent DNA-binding domains, and the rectangles represent domains with other functions.
The numbers inside the SF rectangles represent the SF database identifier for that protein superfamily, and are linked to a detailed description.
The PFAM identifiers inside the boxes are also linked to detailed descriptions of the family.
The long family name can be viewed by holding the mouse over a colored rectangle.
All the domains belonging to one family have the same colored rectangle.
Colors are reused for different families, so that two different families can be represented by the same color.

The sequence ID links provide more detailed results for each predicted transcription factor.
External links are also provided, when available.
Common gene names are provided for the model organisms: Bacillus subtilis, Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Homo sapiens, Mus musculus, Saccharomyces cerevisiae. and Salmonella typhimurium LT2.

The full repertoire of transcription factors may be distributed across several pages of results.
These can be accessed by clicking on the individual page numbers, or downloading the entire set of results from the Download section.


 
Details Genome DB Domain architecture
SPAC1687_05 iz SF
  iz PF
SPAC343_11c iz SF
  iz PF
SPAC31A2_11c iz SF
  iz PF
SPCC584_02 iz SF
  iz PF
SPCC18_03 iz SF
  iz PF
SPAC23E2_01 iz SF
  iz PF
SPCC1393_08 iz SF
  iz PF
SPCC290_04 iz SF
  iz PF
SPCC16A11_14 iz SF
  iz PF
SPCC1902_01 iz SF
  iz PF
SPAPB24D3_01 iz SF
  iz PF
SPBC16G5_17 iz SF
  iz PF
SPAC3H8_08c iz SF
  iz PF
SPBC15D4_02 iz SF
  iz PF
SPAC821_07c iz SF
  iz PF
SPBC27B12_11c iz SF
  iz PF
SPAC2H10_01 iz SF
  iz PF
SPBP8B7_30c iz SF
  iz PF
SPAC1399_05c iz SF
  iz PF
SPAC11D3_07c iz SF
  iz PF
SPBC16G5_16 iz SF
  iz PF
SPAC1486_10 iz SF
  iz PF
SPBC1773_16c iz SF
  iz PF
SPBC530_08 iz SF
  iz PF
SPAC3C7_04 iz SF
  iz PF
SPCC417_09c iz SF
  iz PF
SPBC530_05 iz SF
  iz PF
SPCC757_04 iz SF
  iz PF
SPBPB8B6_04c iz SF
  iz PF
SPCC320_03 iz SF
  iz PF
SPAC1327_01c iz SF
  iz PF
SPCC965_10 iz SF
  iz PF
SPBC1773_12 iz SF
  iz PF
SPAC25B8_11 iz SF
  iz PF
SPAC1F7_11c iz SF
  iz PF
SPCC777_02 iz SF
  iz PF
SPAC139_03 iz SF
  iz PF
SPBC1683_13c iz SF
  iz PF
SPAPB1A11_04c iz SF
  iz PF
SPBC1D7_02c iz SF
  iz PF
SPBC1198_04c iz SF
  iz PF
SPAC144_02 iz SF
  iz PF
SPAC1039_05c iz SF
  iz PF
SPAC6F12_02 iz SF
  iz PF
SPAC11D3_17 iz SF
  iz PF
SPAC144_09c iz SF
  iz PF
SPAC6G10_12c iz SF
  iz PF
SPAC3H1_11 iz SF
  iz PF
SPBP4H10_09 iz SF
  iz PF
SPAC4G8_13c iz SF
  iz PF